小多孢菌（汉语拼音：Xiaoduobaojun；英语：Micropolysporaceae），放线菌目的一科。在气生菌丝和（或）基内菌丝上形成不足20个孢子的短链。如短链小多孢菌，分离自结核病患者的痰液中。马都拉放线菌能产生多种抗生素。