红寺堡区，位于烟筒山，大罗山和牛首山三山之间，东临盐池、西接中宁、南起同心、北连利通区、灵武，东西长约80千米，南北宽约40千米，区域面积1790平方千米。已开发土地31．64万亩。海拔1240～1450米，为山间盆地，属中温带干旱气候区。
红寺堡区辖2镇2乡，即红寺堡镇、太阳山镇、南川乡、大河乡。
1998年9月5日经自治区党委研究，于1999年1月正式挂牌成立中共红寺堡开发区工委。主要搬迁同心、海原、原州、彭阳、西吉、隆德、泾源7县（区）生活在贫困带上的贫困户，是全国最大的扶贫移民开发区。
2001年：1．新设立红寺堡镇，辖17个村民委员会、2个居民委员会。镇人民政府驻红寺堡村。
2．新设立大河乡，辖8个村民委员会。乡人民政府驻大河村。
3．新设立沙泉乡，辖7个村民委员会。乡人民政府驻沙泉村。
4．新设立白墩乡，辖8个村民委员会。乡人民政府驻白墩村。
5．新设立买河乡，辖8个村民委员会。乡人民政府驻买河村。
2002年10月25日，宁夏回族自治区党委、人民政府（宁政发[2002]93号）决定，红寺堡开发区划归吴忠市管辖。
红寺堡区辖红寺堡镇、大河乡、沙泉乡、新庄集乡3乡1镇和石炭沟开发区，81个行政村。现有人口16.4万人。形成2.4平方千米的城市规模，建筑面积40万平方米，城市人口1.5万人，城市绿化率40%。2003年国内生产总值2.42亿元，地方财政收入300万元，农民人均纯收入1478元。
2005年3月24日，宁夏回族自治区第一次经济普查办公室《关于变更吴忠市红寺堡开发区代码的通知》（宁经普办发[2005]12号），红寺堡开发区的代码为640301。相应区划整理如下：
红寺堡镇（640301100）辖：第一居委会、第二居委会；梨花、幸福、红兴、河水、兴旺、团结、富祥、希望、红寺堡、红关、红海、兴盛、甜水河、光彩、玉池、沙草墩、南角湾、白墩、双台、康庄、中圈塘21个村委会。
太阳镇（640301101）辖：朝阳、富康、旧城、沙泉、中泉、新泉、柳泉、甘泉、永泉、东泉、红塔、西泉、水套西、豹子滩、水套、黄羊滩、红崖湾、羊坊滩、买河、周新、小泉21个村委会。
大河乡（640301200）辖：麻黄沟、龙坑、大河、扬黄、开元、红河、香园、碱井、白路、新圈、红崖、龙泉、龙兴13个村委会。
南川乡（640301201）辖：新庄集、马渠、马段头、田卷、王大湾、徐冰水、张家台、细沟子、东川、西川、平岭子、官店、赵花井、马家湾、联一、石坡子、田家湾、上源、中川、新源、东源、新南、新台、红阳、杨柳、南川、南源、龙摆沟28个村委会。
2005年上半年，红寺堡对村级组织进行改革，将原来的94个行政村合并为42个。
2009年10月28日，吴忠市红寺堡区成立，以吴忠市红寺堡镇、太阳山镇、大河乡、南川乡的行政区域为红寺堡区的行政区域，区人民政府驻红寺堡镇。
2011年红寺堡实现GDP8.86亿元，相比增长百分之十八。