真菌门（汉语拼音：Zhenjun Men；英语：Eumycota；Mycobionta），真菌界的一门。通常所称的真菌即指该门菌。营养体大多为分枝繁茂的发达菌丝体，少数菌丝体不发达，一些低等种类为单细胞。细胞壁的主要组分为甲壳质或纤维素。无性繁殖产生游动孢子、孢囊孢子和各种分生孢子等。有性生殖是通过性细胞的结合形成各类有性孢子，如卵孢子、接合孢子、子囊孢子和担孢子等。真菌约10万种以上，广布于全世界，与人类关系密切。根据有无能动细胞（游动孢子或配子）、有无有性孢子以及有性孢子的类型，本门分鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门。
