衣原体属（Chlamydia），原包括多种衣原体，现在分别划到衣原体门的几个科中，本属仅保留沙眼衣原体等两个种。
下属物种
本属包括以下物种：
- 鸟衣原体 Chlamydia avium Sachse et al., 2015
- 家禽衣原体 Chlamydia gallinacea Sachse et al., 2015
- 鼠型沙眼衣原体 Chlamydia muridarum Everett et al., 1999，鼠沙眼衣原体
- 猪衣原体 Chlamydia suis Everett et al., 1999
- 沙眼衣原体 Chlamydia trachomatis (Busacca, 1935) Rake, 1957
